Тоже как инженер скажу, что при работе микроволновки электромагнитное поле СВЧ может прорываться наружу. Если микроволновка плохого качества. И соответственно теоретически навредить.
Но вот, то что в разогретой пище не остается ничего вредного от воздействия СВЧ это совершенно точно.
СВЧ греет воду (влагу) содержащуюся в пище как снаружи так и внутри.
Вы никогда и ни чем не разогреете картофельное пюре, так чтобы оно казалось свежеприготовленным, как это делает микроволновка. (Да еще и за минуту)
А духовке еще и самой разогреться надо.
Спорить о том что лучше не вижу смысла. Это совершенно разные по назначению вещи. Духовка - готовить еду. СВЧ - быстро подогреть.