У меня такая же ситуация. Причем в летнее время более менее норм все было. Сьездил на ТО-3, поменял масло на Лукойл Генезиз, и торозуху. стало реально туго включаться 1 и задняя на холодную. Поехал к официалам, так как машина на гарантии еще. Целый день смотрели, отдали сказали что все нормально, просто особенность МКПП. Дали официальный ответ Фольсквагена.
Вы Кастрол в коробку залили (поменяли) или в ДВС? Сцепление как прокачивали? Сами или на станции через аппарат? Я тоже грешу на воздух в тормозной системе.