они принципиально разные. вы себе представляете как выглядит и строится коробка под продольный мотор а как под поперечный?наверное всетаки они принципиально как раз одинаковые...
коробка Q5 - http://www.autoreview.ru/archive/2008/15/audi_q5/pix/tech/q5080093_750.jpg
коробка VW под поперечный мотор - http://www.roksped.com/vw/files/rs/element/text_pic/2083846734.jpg
видите разницу? у инженеров Ауди гораздо больше места под размещение более массивных и прочных деталей, впервую очередь сцепления...