Artgent, если открутят питание, то и ИБП открутят. Его внутрь магнитолы не установить. Это в любом случае отдельный блок, стоящий за магнитолой, в лучшем случае. От отключения кабелей от магнитолы эта доработка не застрахует.
А вот вынести антенну за контур машины поможет в борьбе с глушилкой.
Опять вопрос в уровне, от чего мы защищаемся.
Если честно, я бы лучше подумал о размещении маячка в пустышке-плавнике, чтобы всю схему там уместить. И может подвести даже питание, чтобы ограничиться небольшим встроенным элементов внутри. Питание замаскировать под антенный кабель, провести его в виде штатной проводки.